KSČM je jediná parlamentní strana, která lisabonskou smlouvu odmítá. Tvrdí, že omezí integritu a suverenitu České republiky, a je proto prý třeba, aby o ní rozhodli občané v referendu stejně, jako rozhodovali o vstupu Česka do EU.
Lidé by podle návrhu KSČM v referendu měli odpovídat na otázku: Souhlasíte s tím, aby Česká republika přistoupila k Lisabonské smlouvě pozměňující Smlouvu o Evropské unii a Smlouvu o založení Evropského společenství? Nemělo by být stanoveno žádné kvorum pro účast voličů.
Vládní politici argumentují tím, že nový dokument pouze upravuje již existující smlouvy EU, a není proto zásadním zásahem do suverenity České republiky. ODS ale zároveň chce, aby nová unijní pravidla přezkoumal Ústavní soud. Opoziční ČSSD prosazuje co nejrychlejší schválení smlouvy v parlamentu.