Práce na nádraží byly součástí rekonstrukce železničního uzlu Břeclav za 2,7 miliardy. Ten by měl být opraven do roku 2010. Výměna opotřebovaných kolejí, zastaralých výhybek a trakčního vedení umožní rychlejší průjezd vlaků. Zatímco dosud musejí vlaky přes přednádraží projíždět osmdesátikilometrovou rychlostí, po rekonstrukci uzlu to bude 130 kilometrů v hodině.
Modernizovaný železniční uzel Břeclav propojí koridory z Děčína přes Prahu, Pardubice, Českou Třebovou a Brno do Břeclavi a z Petrovic u Karviné přes Přerov do Břeclavi s odbočkou z Přerova na Olomouc a Českou Třebovou. Oba koridory byly dostavěny v roce 2004 a dohromady stály 73 miliard korun.
