V rámci sledovacích programů NYPD agenti v civilu monitorovali muslimy v knihkupectvích, restauracích či mešitách, odposlouchávali jejich rozhovory a pronikali také mezi muslimské studenty. Skupiny a jednotlivci z islámských komunit byli sledováni i v případech, kdy neexistovaly důkazy, že by byli nějak spjati s terorismem či jiným zločinem.
Sledovací program NYPD vzbuzoval hněv aktivistů, kteří policii obviňovali z porušování lidských práv a z náboženské a etnické diskriminace. Představitelé NYPD již dříve přiznali, že program nepřinesl žádná zásadní odhalení týkající se terorismu.