Během února 1948 nastala v Československu politická krize, která vyústila demisí ministrů demokratických stran. Prezident Beneš tuto demisi 25. února 1948 přijal a sestavením nové vlády pověřil komunisty v čele s Klementem Gottwaldem. Poté spíše demonstrativně opustil Pražský hrad a uchýlil se do ústraní. Na post prezidenta však rezignovat nechtěl. V květnu 1948 pak Beneš odmítl podepsat novou československou ústavu, Ústavu 9. května, a o měsíc později podepsal abdikační listinu.
Nástupcem Edvarda Beneše se 14. června 1948 stal Klement Gottwald.