„Ať bůh chrání Ameriku“, to byla papežova poslední slova na rozloučenou před nástupem do letadla, k němuž jej vyprovodili viceprezident Dick Cheney, starosta New Yorku Michael Bloomberg a tamní arcibiskup Edward Egan.
Ještě před odletem Benedikt XVI. sloužil mši pro 55 tisíc věřících na baseballovém stadionu týmu Yankees. Byl již třetí hlavou katolické církve, která na tomto stadionu sloužila mši. Dopoledne se papež krátce pomodlil na stejném místě a ve stejný čas, kde se po teroristických útocích 11. září 2001 zhroutily věže Světového obchodního centra.
Papež se během pobytu v USA zabýval hlavně sexuálními skandály amerických katolických kněží a několikrát se za ně omluvil.