Zelaya se do vlasti poněkud překvapivě vrátil bezmála tři měsíce po svém svržení. "Příjemně nás překvapilo, že 'Mel' (Zelayova přezdívka) je už v Tegucigalpě, a požadujeme, aby pučisté respektovali jeho život a důstojnost,„ řekl na kanálu Telesur venezuelský prezident Hugo Chávez, jeden z hlavních Zelayových spojenců. Podle Cháveze putoval Zelaya “celé dva dny pozemní cestou, přes hory a řeky, riskoval svůj život, nakonec ale uspěl a dosáhl hlavního města Hondurasu".
Nový nejvyšší představitel Hondurasu, předseda Senátu Roberto Micheletti, ale informace o Zelayově přítomnosti v Tegucigalpě popírá a označuje je za „mediální terorismus“.
Zelaya byl svržen 28. června pučem armády a pravicových sil. Důvodem tohoto kroku, kterému dal zelenou nejvyšší soud, byl prezidentův pokus uspořádat referendum o změně ústavy s cílem zajistit si druhý mandát. Honduraská ústava opakování mandátu neumožňuje. Zelaya je politickým spojencem kontroverzního venezuelského prezidenta Cháveze, který si už stejnou cestu zajistil možnost časově neomezeného vládnutí.
