Ve sporných červnových prezidentských volbách zvítězil podle oficiálních výsledků dosavadní držitel úřadu Mahmúd Ahmadínežád. Karrúbí stejně jako další neúspěšní kandidáti odmítá vyhlášené výsledky uznat a nehodlá uznávat ani Ahmadínežádem sestavenou vládu.
Po vyhlášení výsledků, které opozice označila za zmanipulované, propukly v Íránu mohutné protestní demonstrace, proti nimž vláda zakročila policejní silou. Íránské úřady oficiálně přiznaly zatčení 4000 osob a 30 mrtvých při největším projevu občanské nespokojenosti od islámské revoluce v roce 1979.
Karrúbí si v srpnu rozhněval úřady tvrzením, že někteří ze zatčených účastníků protestů byli ve věznicích mučeni a znásilňováni. Vyprovokoval tak policejní zásah proti svému úřadu, který teheránský prokurátor nechal počátkem září zavřít a zabavit nalezené dokumenty, počítače a filmy.
