NKÚ také zjistil, že na účtu dlouhodobých podmíněných závazků k prostředkům EU ministerstvo vykazovalo částku o 3,5 miliardy vyšší, než odpovídala skutečnosti.
Vše nejspíš zavinily zmatky v učetnictví ministerstva. V minulém roce totiž byla nastavena nová pravidla pro vedení účetnictví, NKÚ ovšem upozorňuje, že některá nová ustanovení mohly úřady v minulém roce jen těžko uplatnit. „Nejednoznačnosti a nejasnosti aplikace právních předpisů v oblasti účetnictví organizačních složek státu v roce 2010 nemohou být vyčítány ministerstvu školství,“ dodal Nejvyšší kontrolní úřad ve své zprávě.
