Na ministerstvu Novák nahradí odcházejícího náměstka Karla Trůbla, který bude odvolán na základě předchozí dohody s Gandalovičem k poslednímu prosinci. Novák byl ve vedení Lesů ČR (LČR), kterým patří polovina lesů v zemi, od prosince 2007.
Novák uvedl, že ministrovu nabídku na post náměstka dlouho zvažoval. „Beru ji jako ocenění své dosavadní práce,“ řekl Novák. Vyjádřil přesvědčení, že se mu v letošním roce podařilo překonat řadu problémů a posunout společnost dál. Jako příklady jmenoval řešení tendrů na lesnické práce, větrných kalamit a situace na trhu postiženém pádem cen dřeva.
V polovině letošního roku podnik zasáhly diskuse o jeho chodu a hospodaření. Debaty vzbudilo několik výběrových řízení LČR. Například tendr na informační technologie či nákup automobilů. V červenci Česká televize uvedla, že LČR ukládají stamiliony korun do soukromých fondů, aniž o tom informují dozorčí radu nebo ministerstvo. Ministerstvo na to reagovalo prohlášením, že nakládání s penězi podniku má pod kontrolou.