Z peněz univerzity si Benešová navíc údajně nechala za 65 tisíc opravit část svých nemovitostí v Praze a okolí. Funkcionáři školy pak měli od počátku roku 2006 dostat z pokladny univerzity na odměnách 1,5 milionu korun, částky ale Benešová údajně označila za cestovné. Podle obvinění také od roku 2001 odpustila téměř třicítce studentů roční školné ve výši 48 tisíc korun, protože prý pro ni mohli být prospěšní.
